Para descubrir la relación entre la flora bacteriana de la piel y la infección por patógenos, desarrollamos un modelo de infección percutánea utilizando peces cebra y un patógeno que causa la enfermedad de la boca roja entérica en salmones y truchas. El desafío del patógeno, ya sea solo o junto con una punción con una aguja pequeña, no causó infección en los peces. Sin embargo, el estrés por frío, provocado por un cambio en la temperatura del agua de los 28 grados Celsius óptimos para los peces cebra a 20 grados Celsius, causó una infección fatal en los peces heridos tras el desafío con el patógeno. Investigamos los efectos del estrés por frío, la lesión y el desafío del patógeno, solos y en combinación, sobre la flora bacteriana de la piel de los peces utilizando metagenómica de rDNA 16S. Encontramos que el estrés por frío alteró drásticamente la flora bacteriana de la piel, que estaba dominada por en los peces infectados. Además, los peces cuya flora bacteriana intrínseca de la piel fue interrumpida por antibióticos tuvieron su piel ocupada por tras un desafío con este patógeno, aunque los peces sobrevivieron sin lesiones para crear una ruta de invasión en el cuerpo del pez. Nuestros resultados sugieren que la flora bacteriana intrínseca de la piel de los peces los protege de la colonización por patógenos, y que su interrupción por estrés permite a los patógenos colonizar y dominar su piel.