El proceso de desarrollo del músculo esquelético es intrincado e involucra la regulación de una diversa gama de genes. Los perfiles de expresión génica precisos son cruciales para estudiar el desarrollo muscular, lo que hace esencial elegir los genes de referencia adecuados para la PCR cuantitativa en tiempo real (RT-qPCR). En el presente estudio, se identificaron ocho genes de referencia candidatos a partir de nuestro análisis previo de secuenciación del transcriptoma de las células satélite del músculo esquelético caprino (MuSCs), y se evaluaron dos genes de referencia tradicionales (ACTB y GAPDH). Los niveles cuantitativos de los genes de referencia candidatos se determinaron a través de la técnica RT-qPCR, mientras que la estabilidad de su expresión se evaluó utilizando los programas GeNorm, NormFinder, BestKeeper y RefFinder. Además, los genes de referencia elegidos se utilizaron para la normalización de los niveles de expresión génica de PCNA y Myf5. Se determinó que los genes de referencia convencionales, incluidos ACTB y GAPDH, no eran apropiados para normalizar la expresión génica objetivo. Por el contrario, RPL14 y RPS15A, identificados a través del análisis de secuenciación de ARN, mostraron una variabilidad mínima y fueron identificados como los genes de referencia óptimos para normalizar la expresión génica durante la proliferación y diferenciación de las MuSCs caprinas. Nuestra investigación ofrece un panel validado de genes de referencia óptimos para la detección de genes expresados diferencialmente en las células satélite musculares de cabra utilizando RT-qPCR.