La enfermedad de Chagas y la leishmaniasis se encuentran entre las enfermedades tropicales desatendidas más extendidas, y sus terapias actuales tienen una eficacia limitada y varios efectos secundarios tóxicos. El presente estudio informa sobre los perfiles químicos y antikinetoplásmicos de extractos de cinco especies de Celastraceae salvadoreñas contra las etapas de epimastigote y formas de promastigote. El perfil fitoquímico evidenció la presencia de flavonoides, taninos, esteroles y triterpenos como los principales componentes en todas las especies vegetales, mientras que los triterpenoides quinonemétidos (QMTs) se restringieron a la corteza de raíz de las especies estudiadas. La evaluación antikinetoplásmica destaca los extractos de corteza de raíz de las especies como las más prometedoras, exhibiendo una mayor potencia contra (IC 0.71-1.58 ug/mL) y (IC 0.38-2.05 ug/mL) que los fármacos de referencia, benznidazol (IC 1.81 ug/mL) y miltefosina (IC 2.64 ug/mL), respectivamente. Esta potente actividad se relacionó con un excelente índice de selectividad en la línea celular de macrófagos murinos J774A.1. Estos hallazgos refuerzan el potencial de los QMTs como agentes antikinetoplásmicos para el desarrollo de fitofármacos innovadores y las especies vegetales estudiadas como fuente de estos prometedores compuestos líderes.