La conectividad del paisaje se puede evaluar en función de la conexión física (conectividad estructural) o el mantenimiento del flujo entre hábitats dependiendo de las especies (conectividad funcional). La falta de datos empíricos sobre la capacidad de dispersión de las especies puede llevar al uso de medidas estructurales simples. Las comparaciones entre estos enfoques pueden mejorar los procesos de toma de decisiones para la conservación o restauración de hábitats en paisajes fragmentados, como el bioma del Cerrado. Este estudio tuvo como objetivo entender la correspondencia entre las medidas de conectividad estructural y funcional del paisaje para las plantas del Cerrado. Se seleccionaron tres paisajes con parches de cerradão en una matriz de pastizales para la aplicación de estas métricas basadas en la conectividad funcional de cuatro perfiles de capacidad de dispersión de plantas. Los resultados mostraron interpretaciones divergentes entre las medidas de conectividad estructural y funcional del paisaje, indicando que la evaluación de la conservación de la biodiversidad y la conectividad del paisaje depende del conjunto de métricas elegidas. Estructuralmente, los paisajes estudiados tenían el mismo número de parches de cerradão, pero variaban en disponibilidad óptima de recursos, aislamiento, heterogeneidad y agregación. La conectividad funcional fue baja para todos los perfiles (basada en el índice integral de conectividad-IIC) y nula para especies con baja capacidad de dispersión (basada en el índice de conectividad-CONNECT), indicando que las especies con capacidad de dispersión de media a larga distancia pueden verse menos afectadas por la historia de pérdidas y fragmentación del Cerrado en la matriz de pastizales. Las métricas de conectividad funcional utilizadas permitieron un análisis más robusto y, aparentemente, reflejaron mejor la realidad, pero la falta de datos empíricos sobre la capacidad de dispersión y la dificultad para elegir un organismo indicador pueden limitar su uso en la gestión y planificación de áreas de conservación y restauración.