La leptospirosis canina es una enfermedad bacteriana causada por espiroquetas del género. Las infecciones pueden variar desde asintomáticas y crónicas hasta enfermedades clínicas agudas. La enfermedad es endémica en áreas tropicales, como los países de América Latina, pero aún no se ha realizado una comprensión amplia de la dinámica de circulación de cepas, basada en datos moleculares. Basado en análisis in silico, el presente estudio tiene como objetivo analizar la diversidad genética y los patrones de circulación de haplotipos de leptospiras patógenas que infectan a los perros en América Latina. Se obtuvieron secuencias de ADN de la plataforma GenBank, se curaron y alinearon. Se calcularon distancias genéticas y se construyó un árbol de máxima verosimilitud y una red de haplotipos. De acuerdo con los criterios de inclusión adoptados, se identificaron un total de 148 secuencias. La mayoría de los registros eran de Brasil, incluyendo secuencias del serogrupo Icterohaemorrhagiae. El análisis filogenético mostró un clúster genéticamente relacionado, que consiste en un haplogrupo más grande que incluye la cepa de referencia Fiocruz L1-130, conocida por ser la cepa más circulante en humanos. Además, no se observaron variaciones genéticas de acuerdo con la historia clínica y/o la localización geográfica. Describimos la epidemiología molecular de las leptospiras que circulan entre los perros en América Latina y demostramos un grupo muy homogéneo genéticamente, elucidando su patrón de circulación ubicuo y llamando la atención sobre el importante papel de los perros en la dinámica de transmisión de leptospirosis en el contexto de Una Salud.