Los estudios que caracterizan los aislamientos asociados a la enfermedad respiratoria bovina (ERB) son escasos en comparación con la investigación sobre aislamientos de otros hospedadores y antecedentes clínicos. En el presente estudio, se caracterizaron 170 aislamientos de 125 brotes de ERB mediante tipificación capsular y de LPS, así como por virulotipificación. Se identificaron tres tipos capsulares (A, B, F) y tres genotipos de LPS (L2, L3, L6). La tipificación capsular y de LPS reveló una diversidad genética muy baja (DG = 0.02) entre los aislamientos, con la mayoría perteneciendo al genotipo A:L3 (97.6%). La virulotipificación identificó siete perfiles de genes asociados a la virulencia, con dos perfiles que incluían el 95.9% de los aislamientos. Un subconjunto de aislamientos fue caracterizado adicionalmente por MLST y PFGE. Los tipos de secuencia ST79 y ST13 fueron los más frecuentemente identificados y se agruparon en el mismo complejo clonal (CC13), un resultado que apoya la estructura poblacional clonal de los aislamientos asociados a ERB. La tipificación por PFGE también reveló una baja diversidad genética (DG = 0.18), detectando un único patrón en el 62.5% de los brotes en los que se analizaron múltiples aislamientos. En general, el 85.2% de los aislamientos pertenecían a pulsotipos con al menos un 80% de similitud genética, consistente con una estructura poblacional clonal observada por el análisis de MLST y corroborando la relación genética de la mayoría de los aislamientos asociados a la ERB en el ganado.