La mancha de la vaina del arroz (RSB), causada por el hongo patógeno, representa una amenaza significativa para la seguridad alimentaria global. Los mecanismos de defensa que emplea el arroz contra el RSB no se comprenden bien. En nuestro estudio, analizamos las interacciones entre el arroz y comparando los cambios fenotípicos, el contenido de ROS y las variaciones de metabolitos en variedades de arroz tolerantes y susceptibles durante las primeras etapas de la infección fúngica. Notablemente, hubo diferencias fenotípicas distintas en la respuesta entre la variedad tolerante Zhengdao22 (ZD) y la variedad susceptible Xinzhi No.1 (XZ). Observamos que las actividades de cinco enzimas relacionadas con la defensa en ambas variedades, tolerantes y susceptibles, cambiaron dinámicamente de 0 a 72 horas después de la infección. En particular, las actividades de la superóxido dismutasa y la peroxidasa estaban estrechamente asociadas con la resistencia al RSB. El análisis metabolómico reveló 825 metabolitos acumulados diferencialmente (DAMs) entre las variedades tolerantes y susceptibles, con 493 DAMs respondiendo a la infección. Entre estos, los lípidos y moléculas similares a lípidos, compuestos orgánicos de oxígeno, fenilpropanoides y poliketidos, compuestos organoheterocíclicos y ácidos orgánicos y sus derivados fueron los más significativamente enriquecidos. Un DAM, el P-coumaraldehído, que respondió a la infección, se encontró que inhibía efectivamente el crecimiento de. Además, múltiples vías metabólicas, incluyendo el metabolismo de aminoácidos, el metabolismo de carbohidratos, el metabolismo de cofactores y vitaminas, y el metabolismo de terpenoides y poliketidos, probablemente están involucradas en la resistencia al RSB. Nuestra investigación proporciona valiosos conocimientos sobre los mecanismos moleculares subyacentes a la interacción entre el arroz y.