Los hongos micotoxigénicos pueden colonizar cereales de grano pequeño causando graves pérdidas de rendimiento y contaminaciones de granos. Las Fusarias pueden ser responsables de la contaminación de granos de trigo y productos derivados a través de varias clases de micotoxinas, impactando negativamente la salud humana y animal. Entre las estrategias para controlar las micotoxinas se encuentran herramientas analíticas para su identificación y cuantificación desde el campo hasta los alimentos y piensos. Se desarrolló un ensayo de múltiples toxinas rápido basado en la tecnología de interfaz de fantasma reflectante (RPI) para identificar y cuantificar deoxinivalenol, zearalenona y toxinas T-2/HT-2. El flujo de trabajo analítico PRX se organizó de la siguiente manera: un paso rápido de extracción de micotoxinas seguido por un paso analítico realizado en un sistema compuesto por tres elementos: (I) un lector universal capaz de leer una serie de (II) cartuchos que incorporan la tecnología RPI y (III) un software que analiza los datos y proporciona retroalimentación sobre los resultados. El ensayo se evaluó en muestras de referencia de trigo con niveles conocidos de contaminación por toxinas y en muestras de granos contaminados naturalmente. Los resultados obtenidos sugieren que el ensayo puede considerarse una útil herramienta de detección para el control de la contaminación por toxinas en puntos de atención y puntos de venta a lo largo de las cadenas de producción y transformación de trigo.