Se muestrearon conjuntos de moluscos bivalvos de fondo blando a lo largo de un gradiente de profundidad (10 a 100 m) en la plataforma norte de São Paulo durante el verano y el invierno australes. Un análisis unidireccional de la prueba de permutación de similitud reveló que no hubo diferencias estacionales en la estructura de los conjuntos de bivalvos en el área. Un análisis de agrupamiento indicó tres grupos de estaciones correspondientes al gradiente batimétrico. Tanto las curvas de dominancia K como los índices de Shannon y Pielou mostraron una mayor diversidad biológica y una mayor uniformidad en el área menos profunda. La mayoría de los bivalvos encontrados se clasificaron como suspensívoros, coexistiendo con especies de deposición, lo que sugiere la ausencia de interacciones negativas entre estos grupos tróficos. Las diferencias en la frecuencia de perturbaciones a lo largo del gradiente de profundidad causadas por tormentas de olas —más comunes en invierno— y también por la depredación y las actividades antropogénicas, como el dragado de barcos pesqueros y el vertido de aguas residuales, probablemente expliquen la mayor diversidad encontrada en la plataforma interior de Ubatuba.