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Ensamblaje del genoma a nivel de cromosoma y respuesta al estrés por exposición al aire

Autores: Zhou, Yanfeng; Zhang, Xizhao; Tang, Xuemei; Zhou, Yifan; Ding, Yuting; Liu, Hong

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Ensamblaje del genoma a nivel de cromosoma y respuesta al estrés por exposición al aire


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Especies
Estudios genéticos
Piel sin escamas
Estrés por hipoxia
Ensamblaje de novo
Genes que codifican proteínas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 15

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
es una especie particular adecuada para estudios genéticos sobre piel casi sin escamas, transparencia y alta sensibilidad al estrés por hipoxia. Aquí, generamos un ensamblaje de novo de alta calidad a nivel de cromosomas. El ensamblaje final de novo produjo 379.47 Mb con 28 pseudo-cromosomas y una longitud de scaffold N50 de 14.52 Mb. En total, se predijeron 21,074 genes que codifican proteínas, y había formado un clado que se separó hace aproximadamente 115.5 millones de años. En el experimento de estrés por exposición al aire, encontramos que algunos genes juegan un papel esencial durante la hipoxia, como en la vía del ritmo circadiano. Estos datos genómicos ofrecen una base crucial para estudios de ecología y adaptación, así como una comprensión más profunda de la respuesta al estrés por exposición al aire.

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