Ensamblaje del genoma a nivel de cromosoma y respuesta al estrés por exposición al aire
Autores: Zhou, Yanfeng; Zhang, Xizhao; Tang, Xuemei; Zhou, Yifan; Ding, Yuting; Liu, Hong
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Ensamblaje del genoma a nivel de cromosoma y respuesta al estrés por exposición al aire
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Especies
Estudios genéticos
Piel sin escamas
Estrés por hipoxia
Ensamblaje de novo
Genes que codifican proteínas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
es una especie particular adecuada para estudios genéticos sobre piel casi sin escamas, transparencia y alta sensibilidad al estrés por hipoxia. Aquí, generamos un ensamblaje de novo de alta calidad a nivel de cromosomas. El ensamblaje final de novo produjo 379.47 Mb con 28 pseudo-cromosomas y una longitud de scaffold N50 de 14.52 Mb. En total, se predijeron 21,074 genes que codifican proteínas, y había formado un clado que se separó hace aproximadamente 115.5 millones de años. En el experimento de estrés por exposición al aire, encontramos que algunos genes juegan un papel esencial durante la hipoxia, como en la vía del ritmo circadiano. Estos datos genómicos ofrecen una base crucial para estudios de ecología y adaptación, así como una comprensión más profunda de la respuesta al estrés por exposición al aire.
Descripción
es una especie particular adecuada para estudios genéticos sobre piel casi sin escamas, transparencia y alta sensibilidad al estrés por hipoxia. Aquí, generamos un ensamblaje de novo de alta calidad a nivel de cromosomas. El ensamblaje final de novo produjo 379.47 Mb con 28 pseudo-cromosomas y una longitud de scaffold N50 de 14.52 Mb. En total, se predijeron 21,074 genes que codifican proteínas, y había formado un clado que se separó hace aproximadamente 115.5 millones de años. En el experimento de estrés por exposición al aire, encontramos que algunos genes juegan un papel esencial durante la hipoxia, como en la vía del ritmo circadiano. Estos datos genómicos ofrecen una base crucial para estudios de ecología y adaptación, así como una comprensión más profunda de la respuesta al estrés por exposición al aire.