Los enmiendas orgánicos a base de bentonita pueden tener el potencial de mejorar las propiedades microbianas del suelo. El experimento se llevó a cabo de 2014 a 2017 y comprendió cuatro tratamientos: fertilizante NPK (fertilizante mineral de nitrógeno, fósforo y potasio como control), NPK + estiércol de ganado, NPK + bentonita, y NPK + combinación de estiércol con bentonita (MB) para verificar esta hipótesis. Se midió el efecto de los tratamientos en siete propiedades microbianas del suelo diferentes: actividad de deshidrogenasa (DHA), contenido de ácidos grasos de fosfolípidos bacterianos, contenido de ácidos grasos de fosfolípidos fúngicos, carbono de biomasa microbiana (Cmic), 16S rDNA, 18S rDNA y bacterias oxidantes de amoníaco en el suelo. Los resultados mostraron que el tratamiento con solo bentonita aumenta la biomasa bacteriana y fúngica, lo que fue confirmado por el aumento en el número de copias de los genes 16S rDNA y 18S rDNA. Los únicos valores que disminuyeron significativamente con el tratamiento de solo bentonita fueron registrados para DHA y Cmic. La población de bacterias oxidantes de amoníaco aumentó con la aplicación única de bentonita y alcanzó su valor máximo cuando se aplicó bentonita con estiércol. El tratamiento MB mostró el valor más alto para las siete propiedades medidas. En resumen, la aplicación de bentonita por sí sola podría aumentar o disminuir la actividad del suelo, pero su adición, junto con estiércol, siempre promueve una abundancia de microorganismos del suelo y su actividad. La co-aplicación de bentonita con estiércol alteró las propiedades microbianas del suelo en un experimento de campo de 3 años a favor del aumento de la biomasa microbiana, lo cual es beneficioso para la agricultura y el medio ambiente y revela el potencial para la restauración de tierras contaminadas.