Enfoque proteómico durante la inducción de la embriogénesis somática en
Autores: Quintana-Escobar, Ana Odetth; Bojórquez-Velázquez, Esaú; Ruiz-May, Eliel; Loyola-Vargas, Víctor Manuel
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Enfoque proteómico durante la inducción de la embriogénesis somática en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Reguladores del crecimiento de plantas
Embriogénesis somática
Enfoque proteómico
Citoquinina
Auxina
Inducción de SE
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
Los reguladores del crecimiento de las plantas (PGR) son esenciales para la embriogénesis somática (SE) en diferentes especies, y no es la excepción. En nuestro modelo de estudio, previamente, hemos podido elucidar la participación de varios genes involucrados en SE utilizando diferentes estrategias; sin embargo, hasta ahora, no hemos utilizado un enfoque proteómico. Esta investigación busca contribuir a la comprensión de las vías celulares primarias involucradas en el desarrollo de SE en . El proceso de nuestro modelo consiste en dos etapas: (1) preacondicionamiento en medio MS con auxina (NAA) y citoquinina (KIN), y (2) inducción en medio líquido Yasuda añadido con citoquinina (BA). Por lo tanto, en este estudio, analizamos diferentes días del proceso de inducción de SE utilizando proteómica sin etiquetas. Se encontraron 1630 proteínas entre los diferentes días de muestreo del proceso, de las cuales la mayoría se acumularon durante la etapa de inducción. Encontramos que algunas de las vías más enriquecidas durante este proceso fueron la biosíntesis de aminoácidos y metabolitos secundarios. Se encontraron dieciocho proteínas relacionadas con la homeostasis de auxina y dos con el metabolismo de citoquinina, como ABC, BIG, ILR, LOG y ARR. También se identificaron diez proteínas y factores de transcripción relacionados con SE, como SERK1, SKP1, factor de transcripción nuclear Y, caja MADS y calreticulina, y 19 relacionadas con otros procesos de desarrollo de las plantas, entre las cuales destacan las proteínas 14-3-3 y PP2A. Este es el primer informe sobre el enfoque proteómico para elucidar los mecanismos que operan durante la inducción de SE en . Así, nuestros hallazgos proporcionan la base para futuras investigaciones más profundas. Los datos están disponibles a través del Consorcio ProteomeXchange a través del repositorio asociado PRIDE con el identificador del conjunto de datos PXD047172.
Descripción
Los reguladores del crecimiento de las plantas (PGR) son esenciales para la embriogénesis somática (SE) en diferentes especies, y no es la excepción. En nuestro modelo de estudio, previamente, hemos podido elucidar la participación de varios genes involucrados en SE utilizando diferentes estrategias; sin embargo, hasta ahora, no hemos utilizado un enfoque proteómico. Esta investigación busca contribuir a la comprensión de las vías celulares primarias involucradas en el desarrollo de SE en . El proceso de nuestro modelo consiste en dos etapas: (1) preacondicionamiento en medio MS con auxina (NAA) y citoquinina (KIN), y (2) inducción en medio líquido Yasuda añadido con citoquinina (BA). Por lo tanto, en este estudio, analizamos diferentes días del proceso de inducción de SE utilizando proteómica sin etiquetas. Se encontraron 1630 proteínas entre los diferentes días de muestreo del proceso, de las cuales la mayoría se acumularon durante la etapa de inducción. Encontramos que algunas de las vías más enriquecidas durante este proceso fueron la biosíntesis de aminoácidos y metabolitos secundarios. Se encontraron dieciocho proteínas relacionadas con la homeostasis de auxina y dos con el metabolismo de citoquinina, como ABC, BIG, ILR, LOG y ARR. También se identificaron diez proteínas y factores de transcripción relacionados con SE, como SERK1, SKP1, factor de transcripción nuclear Y, caja MADS y calreticulina, y 19 relacionadas con otros procesos de desarrollo de las plantas, entre las cuales destacan las proteínas 14-3-3 y PP2A. Este es el primer informe sobre el enfoque proteómico para elucidar los mecanismos que operan durante la inducción de SE en . Así, nuestros hallazgos proporcionan la base para futuras investigaciones más profundas. Los datos están disponibles a través del Consorcio ProteomeXchange a través del repositorio asociado PRIDE con el identificador del conjunto de datos PXD047172.