En el versátil y dinámico escenario industrial de hoy, cada vez más industrias están adoptando tecnologías y sistemas de fabricación avanzados como el sistema de fabricación flexible (FMS), que combina la eficiencia de una línea de producción en masa con la flexibilidad de un taller de trabajo. El equipo de manipulación de materiales forma un componente importante del FMS y el uso de un equipo de manipulación de materiales adecuado puede mejorar el proceso de producción, proporcionar una utilización efectiva de la mano de obra, aumentar la producción y mejorar la flexibilidad del sistema. En esta investigación, se identifican los principales problemas de manipulación de materiales en un FMS y se evalúan más a fondo utilizando los enfoques ISM y TOPSIS. El propósito de la identificación de estos problemas y su análisis es permitir que los investigadores y gerentes en ejercicio presten la debida atención a estos problemas, lo que puede ayudarles a diseñar los sistemas de manipulación de materiales en sus organizaciones de una mejor manera.