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Hwvoterank: un enfoque de votación basado en red para identificar controladores de cáncer codificantes y no codificantes

Autores: Yu, Dongling; Yu, Zuguo

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2022

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Acceso abierto

Artículo científico
2022

Hwvoterank: un enfoque de votación basado en red para identificar controladores de cáncer codificantes y no codificantes


Categoría

Matemáticas

Subcategoría

Matemáticas generales

Palabras clave

Impulsores del cáncer
Mecanismo de votación basado en redes
Impulsores codificantes y no codificantes
Impulsores de cáncer de miARN
Toma de decisiones clínicas
Centralidad de red y vector propio

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 29

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Los impulsores del cáncer desempeñan un papel importante en la regulación del crecimiento celular, los ciclos celulares y la replicación del ADN. Identificar estos impulsores del cáncer proporciona a los investigadores en cáncer un conocimiento indispensable que tiene importantes implicaciones para la toma de decisiones clínicas. Algunos métodos han sido propuestos recientemente para identificar impulsores del cáncer codificantes y no codificantes a través del análisis de controlabilidad en redes y la centralidad del vector propio basada en la detección de comunidades. Sin embargo, el rendimiento de estos métodos no es satisfactorio. En este trabajo, nos centramos en la estrategia de seleccionar un conjunto de nodos críticos en una red especial de cáncer como impulsores del cáncer, y proponemos un enfoque novedoso para identificar impulsores codificantes y no codificantes a través de un mecanismo de votación basado en la red. Nombramos nuestro enfoque HWVoteRank. En comparación con dos métodos recientes para identificar impulsores del cáncer, CBNA y NIBNA, y tres algoritmos para identificar nodos clave en el conjunto de datos de BRCA, nuestro método puede lograr la mejor eficiencia. Al analizar los resultados, se encontró que nuestro enfoque tiene una mejor capacidad para identificar impulsores del cáncer de miARN. También aplicamos nuestro enfoque a la identificación de impulsores de miARN durante la transición epitelial-mesenquimal y los impulsores para subtipos de cáncer. A través de la investigación bibliográfica, encontramos que esos impulsores explorados por nuestro enfoque tienen una significancia biológica.

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