Muchas hierbas son simultáneamente simbióticas con endófitos fúngicos y hongos micorrícicos arbusculares (AMF). Los endófitos son un grupo de hongos filamentosos que colonizan y crecen dentro de los tejidos aéreos de las plantas, como hojas y tallos. La infección y el crecimiento de hifas de endófitos confieren ventajas de adaptación a las plantas hospederas. Además de producir alcaloides fúngicos y alterar perfiles metabólicos/genéticos del hospedador, está comprobado que la simbiosis de las plantas con endófitos radiculares/foliares afecta la relación planta-suelo. Proponemos que la presencia/infección resulta en variaciones del suelo y de AMF radicular a través de efectos alelopáticos. Realizamos un metaanálisis que integró los efectos alelopáticos de los endófitos en el desarrollo de AMF en hierbas. En la fase pre-simbionte de la simbiosis hierba-AMF, la exudación de raíces de las plantas infectadas afectó positivamente el crecimiento de AMF, mientras que las exudaciones de brotes de las plantas infectadas inhibieron el crecimiento de AMF. En la fase simbiótica de la simbiosis hierba-AMF, se encontró que la infección reducía la colonización micorrícica de raíces en las plantas. No se encontró un patrón en la respuesta de AMF del suelo a la presencia. Este estudio debería mejorar nuestra comprensión del impacto de los endófitos en los simbiontes microbianos subterráneos dentro de la misma planta hospedera. La simbiosis hierba-AMF podría convertirse en un modelo importante para estudiar las interacciones entre la parte aérea y subterránea.