Los circovirus (CVs) y los ciclovirus (CyVs), miembros de la familia, se han identificado solo ocasionalmente en primates no humanos (NHPs). En este estudio, investigamos la presencia y las características genéticas de estos virus en 48 NHPs alojados en el Bioparco-Roma Jardín Zoológico (Italia) y en el Santuario Silvestre Anima Natura Semproniano (Grosseto, Italia), analizando muestras de heces, saliva y suero con una PCR anidada de consenso de amplia reactividad capaz de amplificar una región parcial del gen replicasa (Rep) de miembros de la familia. Se detectó ADN viral en un total de 10 muestras, incluyendo un hisopo de saliva y 9 muestras fecales recolectadas, respectivamente, de cinco macacos japoneses y cuatro mandriles, con una prevalencia general del 18.7% (9/48). En la secuenciación del genoma, cinco cepas revelaron la mayor identidad de nucleótidos (98.3-98.6%) con una cepa de CyV (RI196/ITA) detectada en el contenido intestinal de una lagartija de pared maltesa en Italia. Aunque el origen de las cepas de NHP italianas, genéticamente distantes de los CyVs de NHP detectados previamente, es incierto, nuestros resultados también destacan que el viroma de los animales en cautiverio está modulado por las diferentes fuentes dietéticas y ambientales de exposición.