() es un hongo entomopatógeno significativo (EPF) en la agricultura como un agente de biocontrol aplicable. Tiene el potencial de establecerse como un endófito (ENP) en varios cultivos, lo que resulta en efectos beneficiosos para las plantas huésped, incluyendo resistencia a insectos plaga y un aumento en el crecimiento y rendimiento. Sin embargo, no se sabe si una cepa tiene un impacto tan favorable en la planta, ya que es un microorganismo común del suelo. Por lo tanto, las técnicas que permiten el monitoreo de cepas serán ventajosas. Hasta la fecha, los métodos para detectar o monitorear una cepa específica de EPF después de la aplicación externa son escasos. En el presente estudio, se estandarizó una técnica de PCR anidada in planta para diferenciar entre tres cepas (GHA, PTG4 y BB37) establecidas como endófitas en plantas de frijol en condiciones de laboratorio mediante la detección del perfil de inserción de cuatro intrones del grupo I ubicados en el gen 28S del ADN ribosómico. Esta técnica reconoció un patrón distinto de bandas de diferentes tamaños para cada cepa, con una sensibilidad de 1 pg por 10 ng de ADN vegetal. Este enfoque molecular puede ser más efectivo para monitorear cepas después de la aplicación para evaluar su importancia en los cultivos.