La microbiota intestinal constituye un ecosistema complejo que tiene un impacto importante en la salud del huésped. En este estudio, se utilizaron peces cebra genéticamente modificados con un knockout de sintasa de óxido nítrico inducible (iNOS o NOS2) como modelo para investigar los efectos del knockout de un solo gen y del knockout de doble gen en la composición y función del microbioma intestinal. Un extenso secuenciamiento de 16S rRNA reveló cambios sustanciales en la diversidad microbiana y en las abundancias taxonómicas específicas, sin embargo, no afectó la estructura funcional de los tejidos intestinales. Notablemente, los peces cebra deficientes en iNOS demostraron una disminución en especies y un aumento en especies, con efectos más pronunciados observados en los knockouts dobles. Un análisis transcriptómico adicional del intestino en peces cebra con knockout doble de iNOS indicó alteraciones significativas en las vías relacionadas con la inmunidad y el metabolismo, incluyendo las vías de señalización del complemento y PPAR. Estos hallazgos subrayan la interacción crucial entre la genética del huésped y la microbiota intestinal, indicando que iNOS desempeña un papel clave en la modulación de la ecología microbiana intestinal, el sistema inmunológico del huésped y las respuestas metabólicas.