El transcriptoma revela genes candidatos responsables de la respuesta al estrés por frío en Agave
Autores: Li, Yubo; Hu, Xiaoli; Mkapa, Dietram Samson; Xie, Li; Guo, Pingan; Tan, Shibei; Zhang, Weiyi; Chen, Helong; Huang, Xing; Yi, Kexian
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2025
Acceso abierto
Artículo científico
2025
El transcriptoma revela genes candidatos responsables de la respuesta al estrés por frío en Agave
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Agave
Estrés por frío
Genes
Análisis transcriptómico
Planta ornamental
Funciones moleculares
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 12
Citaciones: Sin citaciones
El agave, con su apariencia única y su capacidad para producir fibras duras, tiene un alto valor económico. Sin embargo, las bajas temperaturas durante el invierno pueden restringir su crecimiento e incluso dañar las hojas, causando una pérdida de atractivo ornamental o afectando la calidad de la fibra. Por otro lado, la familia de la planta juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas y en la respuesta al estrés. Estudiar los genes de la familia es de gran importancia para analizar el mecanismo por el cual el agave responde al estrés por frío. Esta investigación realizó un análisis transcriptómico de la planta ornamental. A través de la ensamblaje mediante secuenciación Illumina, se obtuvieron 119,911 transcritos, incluidos 78,083 unigenes. En total, se identificaron con éxito 6, 10, 11 y 13 genes de , H11648, , y , respectivamente. Estos genes se pueden dividir en cuatro grupos (I, II, III y IV), y el grupo IV se puede dividir en dos subgrupos (IV-A y IV-B). Los niveles de expresión relativa se cuantificaron mediante ensayos de qRT-PCR, que revelaron que se reguló significativamente al alza después del tratamiento con frío y el tratamiento con Ca(NO), lo que sugiere su importancia en el estrés por frío y la señalización de calcio. Además, el ensayo Y2H ha identificado preliminarmente proteínas interactivas de AhCNGC4.1, incluyendo AhCML19 y AhCBSX3. Este estudio ha establecido por primera vez un conjunto de datos transcriptómicos completamente nuevo de , enriqueciendo la bioinformática del transcriptoma del agave. Los genes identificados son de gran importancia para entender la evolución de las especies de agave. Los genes clonados, el análisis del patrón de expresión y los resultados de interacción de proteínas sentaron las bases para futuras investigaciones relacionadas con las funciones moleculares de los genes del agave en la tolerancia al frío.
Descripción
El agave, con su apariencia única y su capacidad para producir fibras duras, tiene un alto valor económico. Sin embargo, las bajas temperaturas durante el invierno pueden restringir su crecimiento e incluso dañar las hojas, causando una pérdida de atractivo ornamental o afectando la calidad de la fibra. Por otro lado, la familia de la planta juega un papel importante en el crecimiento y desarrollo de las plantas y en la respuesta al estrés. Estudiar los genes de la familia es de gran importancia para analizar el mecanismo por el cual el agave responde al estrés por frío. Esta investigación realizó un análisis transcriptómico de la planta ornamental. A través de la ensamblaje mediante secuenciación Illumina, se obtuvieron 119,911 transcritos, incluidos 78,083 unigenes. En total, se identificaron con éxito 6, 10, 11 y 13 genes de , H11648, , y , respectivamente. Estos genes se pueden dividir en cuatro grupos (I, II, III y IV), y el grupo IV se puede dividir en dos subgrupos (IV-A y IV-B). Los niveles de expresión relativa se cuantificaron mediante ensayos de qRT-PCR, que revelaron que se reguló significativamente al alza después del tratamiento con frío y el tratamiento con Ca(NO), lo que sugiere su importancia en el estrés por frío y la señalización de calcio. Además, el ensayo Y2H ha identificado preliminarmente proteínas interactivas de AhCNGC4.1, incluyendo AhCML19 y AhCBSX3. Este estudio ha establecido por primera vez un conjunto de datos transcriptómicos completamente nuevo de , enriqueciendo la bioinformática del transcriptoma del agave. Los genes identificados son de gran importancia para entender la evolución de las especies de agave. Los genes clonados, el análisis del patrón de expresión y los resultados de interacción de proteínas sentaron las bases para futuras investigaciones relacionadas con las funciones moleculares de los genes del agave en la tolerancia al frío.