El presente estudio buscó desarrollar una metodología para analizar la calidad del agua basada en los conceptos y métodos del clima y la climatología. Para ello, intentamos relacionar las técnicas y metodologías hidrometeorológicas y limnometeorológicas con una técnica de análisis rítmico desarrollada en el contexto de la climatología geográfica brasileña. Nuestro objetivo fue evaluar y analizar las floraciones de cianobacterias, principal indicador de la calidad del agua en los embalses de la Cuenca del Alto Tietê y, en consecuencia, en la Región Metropolitana de São Paulo, una zona de alta complejidad ambiental debido a su alto grado de desarrollo y alta densidad poblacional. Los datos meteorológicos utilizados fueron recopilados por el Instituto de Astronomía, Geofísica y Ciencias Atmosféricas de la estación meteorológica de la Universidad de São Paulo, y los datos limnológicos se recopilaron a través del Sistema de Monitoreo Hidrológico implementado por SABESP en los embalses de Billings y Guarapiranga y el laboratorio de la misma entidad. El análisis rítmico e integrado mostró que el proceso de proliferación de cianobacterias depende de una combinación de factores meteorológicos, como la temperatura y la intensidad del viento, que pueden alterar la estabilidad del embalse, creando las condiciones necesarias para su desarrollo durante el proceso de estabilización. El ritmo de la entrada del Frente Polar Atlántico durante el invierno en São Paulo es un factor limitante para el crecimiento de cianobacterias debido a su alta frecuencia, manteniendo así el equilibrio del embalse durante este período. Los factores climáticos que podrían causar inestabilidad en la columna de agua fueron: la entrada del Frente Frío (66,67%), el conflicto entre masas (22,22%) y la Línea de Inestabilidad Tropical (11,11%). La ​​posibilidad de prevención y pronóstico indica cuándo no se deben utilizar estos embalses, principalmente para actividades recreativas.