Se requieren mejoras en la productividad agrícola para satisfacer la demanda de una población mundial en crecimiento. Los fitopatógenos, las malas hierbas y los insectos son desafíos para la producción agrícola. La toxicidad y la aplicación generalizada de pesticidas sintéticos persistentes representan una gran amenaza para la salud humana y de los ecosistemas. Por lo tanto, las estrategias sostenibles para el control de plagas son esenciales para que los sistemas agrícolas mejoren la productividad dentro de un paradigma ecológico. Los aleloquímicos son una alternativa menos persistente, más segura y amigable para una gestión eficiente de plagas, ya que tienden a ser menos tóxicos para los organismos no objetivo y más fácilmente degradables. Las microalgas producen una gran variedad de sustancias alelopáticas cuyo potencial de biocontrol contra malas hierbas, insectos y hongos y bacterias fitopatógenos ha recibido mucha atención. Esta revisión proporciona información actualizada y una perspectiva crítica sobre los aleloquímicos de las microalgas y su potencial como biopesticidas.