El papel de los genes en el arroz cuando se enfrenta a estrés abiótico único y múltiple
Autores: Jeyasri, Rajendran; Muthuramalingam, Pandiyan; Satish, Lakkakula; Adarshan, Sivakumar; Lakshmi, Muthukannan Aishwarya; Pandian, Shunmugiah Karutha; Chen, Jen-Tsung; Ahmar, Sunny; Wang, Xiukang; Mora-Poblete, Freddy; Ramesh, Manikandan
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
El papel de los genes en el arroz cuando se enfrenta a estrés abiótico único y múltiple
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Agronomía y Ciencia de los Cultivos
Palabras clave
Genes
Factores de transcripción
Señalización del estrés
Análisis de expresión
Tejidos en desarrollo
Estrés abiótico
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 20
Citaciones: Sin citaciones
Los genes WRKY son una de las familias más grandes de factores de transcripción (TFs) y desempeñan un papel crucial en ciertos procesos en las plantas, incluida la señalización del estrés, la regulación de la reprogramación transcripcional asociada con respuestas al estrés y otras redes regulatorias. Este estudio tiene como objetivo investigar la familia de genes WRKY en la planta modelo C, utilizando un análisis de expresión in silico a nivel genómico. En primer lugar, se identificaron 104 miembros de la familia de TF WRKY, y luego se analizaron sistemáticamente sus propiedades moleculares y firmas de expresión. El perfil de expresión espaciotemporal e hormonal in silico reveló los roles de los genes y su dinamismo en diversos tejidos de desarrollo y hormonas, respectivamente. El mapeo comparativo entre genes y su sintenia con genomas de C panicoides mostró las perspectivas evolutivas de la familia de TF WRKY. Las interacciones de secuencias génicas codificantes representaron la complejidad del estrés abiótico (AbS) y sus interacciones moleculares. La firma de expresión de 26 genes candidatos novedosos en respuesta a los estreses exhibió la participación putativa de respuestas individuales y combinadas al AbS (CAbS). Estos hallazgos novedosos desentrañan las perspectivas en profundidad de los genes TF y delinean los metabolismo del desarrollo de la planta y sus regulaciones funcionales en condiciones individuales y CAbS.
Descripción
Los genes WRKY son una de las familias más grandes de factores de transcripción (TFs) y desempeñan un papel crucial en ciertos procesos en las plantas, incluida la señalización del estrés, la regulación de la reprogramación transcripcional asociada con respuestas al estrés y otras redes regulatorias. Este estudio tiene como objetivo investigar la familia de genes WRKY en la planta modelo C, utilizando un análisis de expresión in silico a nivel genómico. En primer lugar, se identificaron 104 miembros de la familia de TF WRKY, y luego se analizaron sistemáticamente sus propiedades moleculares y firmas de expresión. El perfil de expresión espaciotemporal e hormonal in silico reveló los roles de los genes y su dinamismo en diversos tejidos de desarrollo y hormonas, respectivamente. El mapeo comparativo entre genes y su sintenia con genomas de C panicoides mostró las perspectivas evolutivas de la familia de TF WRKY. Las interacciones de secuencias génicas codificantes representaron la complejidad del estrés abiótico (AbS) y sus interacciones moleculares. La firma de expresión de 26 genes candidatos novedosos en respuesta a los estreses exhibió la participación putativa de respuestas individuales y combinadas al AbS (CAbS). Estos hallazgos novedosos desentrañan las perspectivas en profundidad de los genes TF y delinean los metabolismo del desarrollo de la planta y sus regulaciones funcionales en condiciones individuales y CAbS.