El Microbioma Endofítico de Vides Silvestres Rupr. y Pulliat Creciendo en el Lejano Oriente Ruso
Autores: Aleynova, Olga A.; Nityagovsky, Nikolay N.; Ananev, Alexey A.; Suprun, Andrey R.; Ogneva, Zlata V.; Dneprovskaya, Alina A.; Beresh, Alina A.; Tyunin, Alexey P.; Dubrovina, Alexandra S.; Kiselev, Konstantin V.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El Microbioma Endofítico de Vides Silvestres Rupr. y Pulliat Creciendo en el Lejano Oriente Ruso
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Uva
Microorganismos endofíticos
Agentes de biocontrol
Secuenciación de próxima generación
Géneros bacterianos
Clases de hongos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Muchos microorganismos endofíticos de la uva exhiben un alto potencial para suprimir el desarrollo de enfermedades de la uva y estimular el crecimiento y la adaptación de la vid, así como propiedades beneficiosas del cultivo. El microbioma de las vides silvestres es una fuente prometedora de agentes de biocontrol, que pueden ser beneficiosos para las vides domesticadas. Utilizando secuenciación de nueva generación (NGS) y técnicas clásicas de microbiología, realizamos un análisis de comunidades endofíticas bacterianas y fúngicas de las vides silvestres Rupr. y Pulliat que crecen en el Lejano Oriente ruso. Según el análisis de NGS, 24 y 18 taxones bacterianos del nivel de clase estaban presentes en las vides, respectivamente. Gammaproteobacteria (35%) fue la clase predominante de bacterias endofíticas en las vides y Alphaproteobacteria (46%) en las otras. Tres taxones, a saber, y fueron los géneros bacterianos más comunes en las vides y . El análisis metagenómico mostró la presencia de 23 y 22 hongos y taxones similares a hongos del nivel de clase en las vides y , respectivamente. Las clases fúngicas predominantes fueron Dothideomycetes (61-65%) y Tremellomycetes (10-11%), mientras que y fueron los géneros fúngicos más comunes en las vides y respectivamente. Un análisis comparativo de las comunidades endofíticas de y con las comunidades endofíticas reportadas previamente reveló que la biodiversidad bacteriana de y era similar en diversidad alfa a la biodiversidad bacteriana de . La diversidad alfa fúngica de y fue estadísticamente diferente de la de . El análisis de diversidad beta de endófitos bacterianos y fúngicos mostró que las muestras de formaron clústeres separados, mientras que las muestras formaron un clúster separado que incluía muestras. Los datos revelaron que la comunidad endofítica de bacterias y hongos de las vides silvestres era más rica que la de las uvas y las uvas cultivadas. Por lo tanto, los datos obtenidos en este trabajo podrían ser de gran valor en la búsqueda de microorganismos potencialmente útiles para la viticultura.
Descripción
Muchos microorganismos endofíticos de la uva exhiben un alto potencial para suprimir el desarrollo de enfermedades de la uva y estimular el crecimiento y la adaptación de la vid, así como propiedades beneficiosas del cultivo. El microbioma de las vides silvestres es una fuente prometedora de agentes de biocontrol, que pueden ser beneficiosos para las vides domesticadas. Utilizando secuenciación de nueva generación (NGS) y técnicas clásicas de microbiología, realizamos un análisis de comunidades endofíticas bacterianas y fúngicas de las vides silvestres Rupr. y Pulliat que crecen en el Lejano Oriente ruso. Según el análisis de NGS, 24 y 18 taxones bacterianos del nivel de clase estaban presentes en las vides, respectivamente. Gammaproteobacteria (35%) fue la clase predominante de bacterias endofíticas en las vides y Alphaproteobacteria (46%) en las otras. Tres taxones, a saber, y fueron los géneros bacterianos más comunes en las vides y . El análisis metagenómico mostró la presencia de 23 y 22 hongos y taxones similares a hongos del nivel de clase en las vides y , respectivamente. Las clases fúngicas predominantes fueron Dothideomycetes (61-65%) y Tremellomycetes (10-11%), mientras que y fueron los géneros fúngicos más comunes en las vides y respectivamente. Un análisis comparativo de las comunidades endofíticas de y con las comunidades endofíticas reportadas previamente reveló que la biodiversidad bacteriana de y era similar en diversidad alfa a la biodiversidad bacteriana de . La diversidad alfa fúngica de y fue estadísticamente diferente de la de . El análisis de diversidad beta de endófitos bacterianos y fúngicos mostró que las muestras de formaron clústeres separados, mientras que las muestras formaron un clúster separado que incluía muestras. Los datos revelaron que la comunidad endofítica de bacterias y hongos de las vides silvestres era más rica que la de las uvas y las uvas cultivadas. Por lo tanto, los datos obtenidos en este trabajo podrían ser de gran valor en la búsqueda de microorganismos potencialmente útiles para la viticultura.