El Método de Matriz de Representación, Análisis y Clasificación de Largas Secuencias Genéticas
Autores: Stepanyan, Ivan V.; Petoukhov, Sergey V.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2017
Acceso abierto
Artículo científico
2017
El Método de Matriz de Representación, Análisis y Clasificación de Largas Secuencias Genéticas
Categoría
Gestión y administración
Subcategoría
Gestión de la tecnología y la inovación
Palabras clave
Método de matriz
Análisis comparativo
Largas secuencias de nucleótidos
Secuencias binarias digitales
Simetrías
Matrices genéticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 1
Citaciones: Sin citaciones
El artículo está dedicado a un método matricial de análisis comparativo de largas secuencias de nucleótidos mediante la presentación de cada secuencia en forma de tres secuencias binarias digitales. Este método utiliza un conjunto de simetrías de atributos bioquímicos de los nucleótidos. También utiliza la posibilidad de presentar cada conjunto completo de N-mers como uno de los miembros de una familia de matrices genéticas de Kronecker. Con este método, una larga secuencia de nucleótidos puede ser representada visualmente como un mosaico individual de tipo fractal o como otro mosaico regular de tipo binario. En contraste con las secuencias de nucleótidos naturales, las secuencias aleatorias artificiales dan patrones no regulares. Se muestran ejemplos de mosaicos binarios de largas secuencias de nucleótidos, incluidos casos de cromosomas humanos y penicilinas. Luego se discuten los resultados obtenidos.
Descripción
El artículo está dedicado a un método matricial de análisis comparativo de largas secuencias de nucleótidos mediante la presentación de cada secuencia en forma de tres secuencias binarias digitales. Este método utiliza un conjunto de simetrías de atributos bioquímicos de los nucleótidos. También utiliza la posibilidad de presentar cada conjunto completo de N-mers como uno de los miembros de una familia de matrices genéticas de Kronecker. Con este método, una larga secuencia de nucleótidos puede ser representada visualmente como un mosaico individual de tipo fractal o como otro mosaico regular de tipo binario. En contraste con las secuencias de nucleótidos naturales, las secuencias aleatorias artificiales dan patrones no regulares. Se muestran ejemplos de mosaicos binarios de largas secuencias de nucleótidos, incluidos casos de cromosomas humanos y penicilinas. Luego se discuten los resultados obtenidos.