La deficiencia de hierro causada por el alto pH del suelo salino-alcalino es una fuente importante de estrés abiótico que afecta el crecimiento de las plantas. Sin embargo, el mecanismo molecular subyacente a la respuesta de deficiencia de hierro en el algodón es poco comprendido. En este estudio, investigamos los impactos de la deficiencia de hierro en la etapa de plántula de algodón y elucidamos la red de regulación molecular correspondiente, que se centró en un gen clave. La deficiencia de hierro indujo la expresión de genes con roles en la respuesta a la deficiencia de hierro, especialmente. La supresión de con tecnología de silenciamiento génico inducido por virus redujo la tolerancia de las plántulas a la deficiencia de hierro, con baja eficiencia fotosintética y daño severo a la estructura del cloroplasto. Por el contrario, la expresión ectópica de en mejoró la tolerancia a la deficiencia de hierro. Un análisis adicional de interacciones proteína/proteína reveló que GhbHLH121 puede interactuar con GhbHLH IVc y GhPYE. Además, GhbHLH121 puede activar directamente la expresión de, e independientemente de GhbHLH IVc. En resumen, GhbHLH121 es un regulador positivo de la respuesta a la deficiencia de hierro en el algodón, regulando directamente la absorción de hierro como el gen ascendente de. Nuestros resultados proporcionan información sobre la compleja red de la respuesta a la deficiencia de hierro en el algodón.