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El componente de ARN pequeño del savia del floema y su respuesta a la deficiencia de hierro

Autores: Bakirbas, Ahmet; Castro-Rodriguez, Rosario; Walker, Elsbeth L.

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

El componente de ARN pequeño del savia del floema y su respuesta a la deficiencia de hierro


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Botánica

Palabras clave

Deficiencia de hierro
Secuenciación de ARN
Fragmentos derivados de tRNA
MiARN
SARN
Savia del floema

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 14

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
Para descubrir sRNA que podrían funcionar durante el estrés por deficiencia de hierro, se preparó ARN a partir de exudados de floema y se utilizó para RNA-seq. Los resultados del bioanalizador indican que el ARN abundante del floema es pequeño en tamaño, menos de 200 nt. Además, no se observaron bandas típicas de rRNA. La secuenciación de ocho muestras independientes de ARN de floema indicó que los fragmentos derivados de tRNA, específicamente 5 tRFs y 5 mitades de tRNA, son altamente abundantes en la savia del floema, constituyendo aproximadamente el 46% de todas las lecturas. Además, se definió un conjunto de miARN que están presentes en la savia del floema, y se identificaron varios miARN y sRNA que se expresan de manera diferencial durante la deficiencia de hierro.

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