El componente de ARN pequeño del savia del floema y su respuesta a la deficiencia de hierro
Autores: Bakirbas, Ahmet; Castro-Rodriguez, Rosario; Walker, Elsbeth L.
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El componente de ARN pequeño del savia del floema y su respuesta a la deficiencia de hierro
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Deficiencia de hierro
Secuenciación de ARN
Fragmentos derivados de tRNA
MiARN
SARN
Savia del floema
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
Para descubrir sRNA que podrían funcionar durante el estrés por deficiencia de hierro, se preparó ARN a partir de exudados de floema y se utilizó para RNA-seq. Los resultados del bioanalizador indican que el ARN abundante del floema es pequeño en tamaño, menos de 200 nt. Además, no se observaron bandas típicas de rRNA. La secuenciación de ocho muestras independientes de ARN de floema indicó que los fragmentos derivados de tRNA, específicamente 5 tRFs y 5 mitades de tRNA, son altamente abundantes en la savia del floema, constituyendo aproximadamente el 46% de todas las lecturas. Además, se definió un conjunto de miARN que están presentes en la savia del floema, y se identificaron varios miARN y sRNA que se expresan de manera diferencial durante la deficiencia de hierro.
Descripción
Para descubrir sRNA que podrían funcionar durante el estrés por deficiencia de hierro, se preparó ARN a partir de exudados de floema y se utilizó para RNA-seq. Los resultados del bioanalizador indican que el ARN abundante del floema es pequeño en tamaño, menos de 200 nt. Además, no se observaron bandas típicas de rRNA. La secuenciación de ocho muestras independientes de ARN de floema indicó que los fragmentos derivados de tRNA, específicamente 5 tRFs y 5 mitades de tRNA, son altamente abundantes en la savia del floema, constituyendo aproximadamente el 46% de todas las lecturas. Además, se definió un conjunto de miARN que están presentes en la savia del floema, y se identificaron varios miARN y sRNA que se expresan de manera diferencial durante la deficiencia de hierro.