El cadmio (Cd) es un contaminante severo de metales pesados a nivel mundial. Es una importante hierba perenne de temporada cálida que potencialmente juega un papel en la fitoremediación en áreas de suelo contaminadas con Cd; sin embargo, los mecanismos moleculares subyacentes a su respuesta al estrés por Cd son desconocidos. Para investigar más a fondo el patrón de respuesta génica temprana bajo estrés por Cd, se recolectaron hojas de plantas 0, 6, 12 y 24 horas después del tratamiento con estrés por Cd (400 M CdCl) y se utilizaron para un análisis de secuenciación de ARN a lo largo del tiempo. Se construyeron y secuenciaron doce bibliotecas de cDNA, y se obtuvieron datos de alta calidad, cuyos índices de mapeo fueron todos superiores al 94%, y se generaron más de 601 millones de pares de bases de secuencia. Se identificaron un total de 5321, 6526 y 4016 genes expresados diferencialmente 6, 12 y 24 horas después del tratamiento con estrés por Cd, respectivamente. Un total de 1660 genes se expresaron diferencialmente en los tres puntos temporales, y se elucidaron sus perfiles de expresión génica a lo largo del tiempo. Basado en el análisis de estos genes, se identificaron los mecanismos importantes para la respuesta al estrés por Cd. Se analizaron en detalle genes específicos que participan en el metabolismo del glutatión, la señalización y transducción de hormonas vegetales, miembros del procesamiento de proteínas en el retículo endoplásmico, proteínas transportadoras, factores de transcripción y vías de metabolismo de carbohidratos. Estos genes pueden contribuir a la mejora de la tolerancia al Cd. Además, se destacaron algunos genes candidatos para futuros estudios sobre la resistencia al estrés por Cd en otras plantas. Nuestros resultados ilustran la respuesta de expresión génica temprana de las hojas al Cd y proporcionan una nueva comprensión de los mecanismos moleculares del estrés por Cd en especies.