Antecedentes: La hipertensión pulmonar (HP) es una enfermedad vasoconstrictora caracterizada por una presión arterial pulmonar media (PAPm) elevada en reposo. La hipertensión arterial pulmonar idiopática (HAPi) y la hipertensión pulmonar tromboembólica crónica (HPTEC) representan dos subtipos distintos de HP. La HP persistente conduce a la hipertrofia del ventrículo derecho (VD), insuficiencia cardíaca y muerte. El rendimiento del VD predice la supervivencia y las intervenciones quirúrgicas que restablecen la PAPm fisiológica revierten el remodelado cardíaco. No obstante, un número considerable de pacientes con HP son considerados inoperables. Sin embargo, los mecanismos subyacentes que rigen la regeneración cardíaca siguen siendo en gran medida elusivos. Métodos: En un enfoque longitudinal, perfilamos los paisajes transcripcionales de VDs hipertróficos y corazones recuperados 3 meses después de la cirugía en pacientes con HAPi y HPTEC. Resultados: Los genes asociados con respuestas celulares a estímulos inflamatorios y iones metálicos fueron regulados a la baja, y se indujo el desarrollo del tejido muscular cardíaco en HAPi tras la recuperación. En pacientes con HPTEC, los genes relacionados con el desarrollo de células musculares disminuyeron, y los genes que rigen la conducción cardíaca se regularon al alza en los VDs tras la regeneración. Curiosamente, la respuesta temprana de crecimiento 1 (EGR1), un regulador profibrótico, fue identificada como un factor de transcripción principal de los VDs hipertróficos en HAPi y HPTEC. Una evaluación histológica confirmó nuestros resultados biocomputacionales y sugirió un papel fundamental para EGR1 en la vasculopatía del VD. Conclusión: Nuestros hallazgos mejoraron nuestra comprensión de los eventos moleculares que impulsan el remodelado cardíaco inverso tras la cirugía. EGR1 podría representar un candidato prometedor para la terapia dirigida de pacientes con HP no elegibles para tratamiento quirúrgico.