La variabilidad genética es esencial para la identificación de genotipos con características nutricionales mejoradas. Este estudio tuvo como objetivo caracterizar genotipos en función de la acumulación de nutrientes en los frutos, evaluados durante dos cosechas consecutivas. El experimento siguió un diseño de bloques al azar con cuatro repeticiones, que comprendía 42 genotipos. Para evaluar la acumulación de nutrientes, se recolectaron muestras de fruta de cada genotipo y se secaron en horno. En un laboratorio de análisis de tejidos vegetales, se determinaron las concentraciones de N, P, K, Ca, Mg, S, Fe, Mn, Cu, Zn y B. La acumulación de nutrientes en los frutos se calculó como masa seca x concentración de nutrientes, y los datos se convirtieron a kg o g de nutrientes acumulados por tonelada de granos de café con un contenido de humedad del 12%. Los resultados revelaron una variabilidad significativa entre los genotipos en la acumulación de nutrientes, siendo el orden general de acumulación N > K > Ca > Mg > S > P > Mn > Fe > B > Cu > Zn. El análisis multivariante identificó siete grupos, con Verdim R, Clementino y Pirata formando clústeres distintos debido a sus características únicas. Clementino mostró la mayor acumulación de nutrientes, mientras que LB1 tuvo la más baja. El estudio demostró una alta heredabilidad para todos los rasgos, indicando un fuerte control genético, junto con correlaciones positivas significativas entre nutrientes. Estos hallazgos destacan el potencial de seleccionar genotipos eficientes en nutrientes para mejorar la sostenibilidad del cultivo de café. Los datos nutricionales obtenidos pueden apoyar el desarrollo de cultivares más nutricionalmente eficientes, asegurando la sostenibilidad a largo plazo en la producción de café.