Los métodos de captura pueden influir considerablemente en el muestreo de comunidades de mamíferos. Este estudio comparó la eficiencia de la captura de pequeños mamíferos con trampas Sherman en dos posiciones (a nivel del suelo y en árboles) y con trampas de caída en un paisaje fragmentado. Las sesiones de captura se llevaron a cabo entre octubre de 2008 y octubre de 2009 en dos fragmentos (8 y 17 ha), un corredor agroforestal entre ellos y el pastizal adyacente. Un total de 4622 noches de captura resultó en 155 capturas de 137 individuos de seis especies. Las trampas tuvieron mayor éxito (4,03%), seguidas de las Sherman en el suelo (2,98%) y en árboles (2,37%; χ² = 6,50, p = 0,04). Se capturaron cinco especies con trampas Sherman de suelo, cuatro con trampas y solo dos en árboles. No se observaron diferencias entre los tipos de trampas para marsupiales (χ² = 4,75; p = 0,09), mientras que para roedores, las trampas de caída fueron más eficientes que las trampas Sherman en el suelo (prueba exacta de Fisher, p = 0,02). Como resultado, la eficiencia de cada tipo de trampa difirió entre hábitats, debido a las diferencias en la composición de sus especies. Las trampas de caída fueron más eficientes en la época de lluvias (prueba exacta de Fisher, p <0,0001), mientras que las trampas Sherman en árboles fueron más eficientes en la época seca (prueba exacta de Fisher, p = 0,009). No se observaron diferencias entre estaciones para las trampas Sherman en el suelo (prueba exacta de Fisher, p = 0,76). Considerando los resultados encontrados, recomendamos que los estudios futuros sobre comunidades de mamíferos forestales, en particular aquellos diseñados para evaluar los efectos de la fragmentación forestal, incluyan combinaciones de diferentes tipos de trampas.