El manzano, miembro de la familia Rosaceae, tiene un valor económico significativo pero enfrenta desafíos poscosecha, como el moho azul causado por Penicillium expansum y el moho gris causado por Botrytis cinerea. Aunque los fungicidas sintéticos son ampliamente utilizados, sus limitaciones resaltan la necesidad de alternativas sostenibles. Este estudio explora las propiedades antifúngicas de extractos de Malus domestica, var. Golden Delicious, Fuji, y Granny Smith contra estos patógenos. Las pruebas in vitro evaluaron la inhibición del crecimiento micelial, mientras que los ensayos in vivo consistieron en la medición de la pérdida de peso, firmeza, sólidos solubles totales, acidez titulable e índice de madurez. Además, se determinaron las características fitoquímicas de los extractos utilizando el método de Folin-Ciocalteu y HPLC. Los resultados revelaron una notable actividad antifúngica, especialmente para el extracto de Malus domestica var. Golden Delicious a una concentración de 300 g L, lo que llevó a una inhibición significativa del crecimiento micelial (61% para Penicillium expansum y 41% para Botrytis cinerea), una reducción en la severidad de las enfermedades (39% y 50%), y una notable disminución en la incidencia de las enfermedades (43% y 48%), respectivamente. El análisis fitoquímico reflejó la presencia de fenoles y flavonoides en los extractos probados. Importante destacar que los tratamientos naturales ayudaron a preservar la calidad de las manzanas durante el almacenamiento. Estudios de acoplamiento molecular además revelaron que los compuestos principales en el extracto inhiben la enzima 14-alfa-demetilasa, un objetivo clave en la biosíntesis de esteroles fúngicos.