El edamame es una soja verde rica en nutrientes. El edamame hervido se ha utilizado tradicionalmente como alimento en la región de Asia Oriental. Se sabía entre los agricultores que condiciones como la temperatura y el clima en el día de la cosecha afectan la calidad del edamame. Los agricultores a gran escala cosechan edamame en múltiples días del mismo año; sin embargo, la calidad del edamame varía de un día a otro debido a las variaciones en las condiciones climáticas. En este estudio, cosechamos edamame durante varios días entre 2013 y 2018, obtuvimos las condiciones climáticas en la fecha de cosecha y realizamos un análisis del metaboloma utilizando espectrometría de masas por electroforesis capilar. Para aclarar la correlación entre las condiciones climáticas antes de la fecha de cosecha y los componentes del edamame, se realizaron análisis comparativos de los datos meteorológicos y metabolómicos obtenidos. Encontramos correlaciones positivas y negativas entre la duración de la luz solar y la temperatura media, y las cantidades de algunos componentes del edamame. Además, se observaron correlaciones entre las fluctuaciones anuales en las condiciones climáticas y los componentes del edamame. Nuestros hallazgos sugieren que las condiciones climáticas antes de la fecha de cosecha están estrechamente relacionadas con la calidad del edamame.