El crecimiento poblacional en áreas urbanas altera los ecosistemas de agua dulce, lo cual puede tener consecuencias para las comunidades de macrófitos, como se observa en los municipios que bordean el río Capibaribe, Pernambuco, Brasil. Este estudio informa los efectos de la urbanización en la composición y estructura de las comunidades de macrófitos en áreas a lo largo de dicho río. Se seleccionaron los siguientes sitios de muestreo, urbanizados y no urbanizados: Sitios 1 y 2 (municipio de Santa Cruz do Capibaribe), Sitios 3 y 4 (municipio de Toritama), y Sitios 5 y 6 (región metropolitana de Recife). Estos sitios se visitaron cada dos meses de enero a julio de 2013 para observar la variación estacional (temporada húmeda y seca). Se identificaron 31 especies. En general, los sitios no urbanizados presentaron un mayor número de especies. Los análisis multivariados indicaron diferencias generales significativas entre las zonas urbanizadas y no urbanizadas (R = 0,044; p < 0,001) y entre estaciones (R = 0,018; p < 0,019). Debido a la gran variación en las características físicas, químicas y biológicas entre las zonas urbanizadas y no urbanizadas, se observó que la urbanización influyó significativamente en la composición florística y la estructura de las comunidades de macrófitos.