Cylindrospermopsis raciborskii (Woloszynska) Seenayya et Subba Raju (Ordem Nostocales) es una de las especies de floración más problemáticas en Brasil. Comprender la dinámica poblacional de los diferentes morfotipos de C. raciborskii (recto y enrollado) podría ayudar a predecir las condiciones favorables para la proliferación de esta especie, potencialmente productora de toxinas. El objetivo del presente estudio fue evaluar los efectos de dos intensidades de luz y temperaturas diferentes en la tasa de crecimiento y la morfología de los tricomas de los morfotipos recto y enrollado. Para ello, se utilizaron dos cepas de C. raciborskii no productoras de toxinas: una con un tricoma enrollado (ITEP31) y otra con un tricoma recto (ITEP28). Las cepas se cultivaron en medio BG-11 en una cámara climática bajo condiciones controladas. Se combinaron dos intensidades de luz (30 y 90 µmol.m–2.s–1) a temperaturas de 21 y 31 °C y se analizaron la tasa de crecimiento y los cambios morfológicos. Los morfotipos respondieron de forma diferente a las distintas temperaturas e intensidades de luz. Ambas cepas mostraron velocidades de crecimiento más rápidas al ser sometidas a mayor intensidad de luz y temperatura. La menor temperatura y la mayor luminosidad dificultaron el desarrollo de ambas cepas. Las variaciones en la morfología celular y la ausencia de acinetos en ambas cepas se relacionaron con la menor temperatura (21 °C). El morfotipo enrollado demostró una considerable plasticidad fenotípica, modificando la morfología del tricoma a lo largo de su curva de crecimiento. Aunque el análisis molecular no permite separar los morfotipos como especies distintas, sus diferentes respuestas ecofisiológicas deberían considerarse un conocimiento adicional de suma importancia para el control poblacional de estos organismos potencialmente tóxicos.