Los ecosistemas de humedales juegan un papel significativo en el ciclo global del carbono y, sin embargo, están cada vez más amenazados por el desarrollo humano y el cambio climático. La continua pérdida de humedales de agua dulce intactos aumenta la necesidad de una creación y restauración efectivas de humedales. Sin embargo, la estructura y función de los humedales están controladas por factores abióticos y bióticos que interactúan, lo que complica los esfuerzos por reemplazar los servicios ecosistémicos asociados con los humedales naturales y hace que la gestión impulsada ecológicamente sea imperativa. El aumento de las poblaciones de aves acuáticas representa una amenaza para el desarrollo y la persistencia de los humedales creados, principalmente a través del pastoreo intensivo que puede alterar la estructura de la comunidad de vegetación o limitar el establecimiento de plantas deseadas. Este estudio se aprovechó de un experimento de exclusión de herbívoros a largo plazo para evaluar cómo la gestión de herbívoros impacta el ciclo y almacenamiento de carbono en un humedal creado en el oeste de Nueva York, EE. UU. Se evaluaron la vegetación, la biomasa aérea y subterránea, el carbono del suelo, los flujos de gas de carbono y las tasas de descomposición en parcelas de control con acceso libre de grandes pastadores y en parcelas donde los pastadores habían sido excluidos durante cuatro años. Las aves acuáticas eran el herbívoro dominante en el sitio. El pastoreo redujo la biomasa aérea en la temporada de crecimiento pico en más del 55%, y durante el verano, la productividad primaria bruta se duplicó en las parcelas de exclusión de pastadores. El cambio en la productividad de las plantas llevó a un aumento del 34% en el carbono del suelo después de la exclusión de pastadores durante cinco temporadas de crecimiento, pero no hubo cambio en la biomasa subterránea. Nuestros resultados sugieren que los pastadores pueden inhibir el desarrollo de los reservorios de carbono del suelo durante la primera década posterior a la creación del humedal, reduciendo el potencial de secuestro de carbono y impidiendo la equivalencia funcional con los humedales naturales.