Las aguas residuales tratadas (TWW) se consideran como una alternativa para la irrigación agrícola. El objetivo de este estudio fue comprender los efectos a medio y largo plazo de TWW en los parámetros fisicoquímicos del suelo. Dos perímetros (P y P) que recibían TWW durante 38 y 20 años, respectivamente, en Túnez fueron seleccionados para el estudio. En cada perímetro, se adoptaron dos tipos de agua: TWW y agua subterránea (GW). Se midieron rasgos fisicoquímicos del suelo (pH, CE y concentraciones de Na, K, Ca y Mg) hasta 100 cm, y se calcularon tres índices: índice de adsorción de sodio (SAR), relación de cationes de estabilidad estructural (CROSS) y capacidad de intercambio catiónico (CEC). En general, todos los parámetros del suelo se vieron afectados significativamente en el área de riego que utilizaba GW. Sin embargo, en el caso de TWW, solo se encontró que el pH se vio afectado, aumentando en un 4,7% de P a P. Además, en comparación con GW, TWW aumentó la salinidad del suelo en un 127%, especialmente en suelos subsuperficiales más profundos. Más interesantemente, los resultados revelaron una acumulación de Mg, Ca y K y una disminución de Na en la superficie del suelo. Especialmente, TWW mostró los índices más bajos de CROSS y SAR, lo que indica los beneficios de aplicar TWW incluso después de un uso a largo plazo para mejorar los parámetros fisicoquímicos del suelo como la sodicidad y la estabilidad estructural. Nuestros resultados proporcionan información valiosa para los tomadores de decisiones sobre el uso de aguas residuales en suelos marginales irrigados.