La vacunación es el método más rentable para controlar la paratuberculosis en el ganado lechero, pero sus efectos en la respuesta inmune local en el intestino no se comprenden bien. Este estudio evaluó la respuesta innata local y mediada por células en terneros vacunados con Silirum y posteriormente infectados con paratuberculosis. Se tomaron muestras del granuloma en el sitio de inyección, los ganglios linfáticos escapulares y mesentéricos, y el intestino. Los resultados muestran que los terneros vacunados con formas focales que controlan la infección presentaron una respuesta innata robusta en el intestino, con una fuerte inmunidad mediada por células en los granulomas. También se observó una respuesta innata y proinflamatoria regulada positivamente en el sitio de la inyección. En contraste, los animales con progresión de la enfermedad con lesiones multifocales o difusas, tanto vacunados como no vacunados, mostraron una débil inmunidad innata intestinal y una respuesta antiinflamatoria en los granulomas. En resumen, la vacunación con Silirum mejora la respuesta inmune en el intestino, contribuyendo potencialmente a la protección contra la paratuberculosis.