Los arroyos pueden presentar diferencias en la estructura comunitaria de la deriva de invertebrados, lo cual podría ser un reflejo de la variación en los factores ambientales, capaces de cambiar en condiciones de intervenciones antropogénicas. El objetivo de este estudio fue analizar la composición, diversidad y abundancia de insectos que se desplazan en dos arroyos neotropicales con diferentes usos del suelo e identificar los factores ambientales que determinan dichos patrones. Se identificaron 54 taxones de insectos acuáticos en arroyos urbanos y rurales. Los resultados indicaron diferencias significativas en la composición de especies debido al reemplazo de especies especialistas por especies generalistas en el arroyo urbano. Se registró una mayor diversidad de taxones en el arroyo rural, con altos niveles de oxígeno disuelto y un caudal elevado, lo que favoreció la presencia de grupos sensibles a las perturbaciones ambientales, como los taxones de Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera y Coleoptera, que viven principalmente en aguas limpias y bien oxigenadas. Por otro lado, se observó una mayor densidad de insectos a la deriva, especialmente quironómidos, en el arroyo urbano, donde se observaron altos valores de pH, conductividad eléctrica y nitrógeno. Estas larvas pueden explorar una amplia gama de condiciones ambientales gracias a su gran capacidad de adaptación fisiológica. A pesar de observar los patrones esperados, no se observaron diferencias significativas entre arroyos en cuanto a la diversidad y abundancia de especies. Por lo tanto, la composición de especies puede considerarse el mejor predictor de los impactos en la comunidad de insectos a la deriva.