En diciembre de 2014, un nuevo virus de fiebre aftosa (FMD) fue introducido en una granja de cerdos en Corea del Sur, a pesar de que los animales estaban vacunados. Un emparejamiento antigénico marginal entre las cepas nuevas y las cepas de la vacuna potencialmente llevó a la infección de los animales vacunados. Para entender el impacto del uso de una vacuna contra la FMD en la dinámica de transmisión de una cepa de campo no emparejada, se emplearon modelos de simulación utilizando datos reportados diariamente sobre casos clínicos de la granja. Los resultados de este estudio indicaron que la inmunización con la vacuna contra la FMD redujo la excreción del nuevo virus de FMD en los cerdos. Sin embargo, no hubo evidencia que sugiriera que la inmunización tuvo un efecto significativo en la reducción del desarrollo de signos clínicos. Estos hallazgos destacan que el uso de una vacuna contra la FMD no emparejada puede confundir el brote al alterar la dinámica de la enfermedad del nuevo virus. Basado en este estudio, enfatizamos la importancia de pruebas continuas para asegurar el emparejamiento antigénico entre las cepas circulantes y el grupo de vacunas.