La estructura de las comunidades ícticas en los ríos neotropicales se ve influenciada por una serie de factores ambientales, espaciales y/o temporales, dado que las diferentes especies ocupan los hábitats que presentan las condiciones más favorables para su supervivencia. El presente estudio busca identificar los principales factores responsables de la estructuración de las comunidades ícticas presentes en el río Xingu medio, examinando la influencia de estos factores, además de la presencia de barreras naturales (cascadas). Para ello, se recopilaron datos trimestralmente entre julio de 2012 y abril de 2013, utilizando redes de enmalle de diferentes tamaños y mallas. Además de los datos bióticos, se midieron 17 variables ambientales. Durante el estudio se recolectó un total de 8485 especímenes de peces, representando 188 especies. Los sólidos disueltos totales, la conductividad, la materia suspendida total y las concentraciones de oxígeno disuelto fueron las variables que mayor influencia tuvieron en las características de la ictiofauna del Xingu medio. Solo las barreras y los períodos hidrológicos desempeñaron un papel determinista significativo, generando gradientes tanto longitudinales como laterales. Esto resalta el papel de la conectividad de los diferentes hábitats presentes en el área de estudio en la estructuración de sus ensambles de peces.