Los cambios en la salinidad ambiental desafían la homeostasis de los peces y pueden afectar el rendimiento fisiológico, como la capacidad de nado y el metabolismo, que son importantes para la búsqueda de alimento, la migración y la evasión de depredadores en la naturaleza. Los efectos del estrés por salinidad en el rendimiento fisiológico son en gran medida específicos de la especie, pero también pueden depender de las diferencias intraespecíficas en las capacidades fisiológicas de las subpoblaciones. Medimos la velocidad crítica de nado (U) y las tasas metabólicas durante el nado y en reposo a salinidades de 0 y 10 en percas europeas de una población con baja tolerancia a la salinidad (LSTP) y una población con alta tolerancia a la salinidad (HSTP). La U de LSTP se redujo significativamente a una salinidad de 10, pero no se vio afectada por el cambio de salinidad en HSTP. No detectamos un costo significativo de la osmorregulación, que teóricamente debería ser evidente a partir de las tasas metabólicas durante el nado y en reposo a una salinidad de 0 en comparación con una salinidad de 10 (isoosmótica). Las tasas metabólicas máximas tampoco se vieron afectadas por la salinidad, lo que indica un modesto compromiso entre la respiración y la osmorregulación (compromiso osmo-respiratorio). Las diferencias intraespecíficas en los efectos de la salinidad sobre el rendimiento fisiológico son importantes para que las especies de peces mantengan la compatibilidad ecológica en ambientes estuarinos, pero hacen que estas subpoblaciones sean vulnerables a la pesca. Por lo tanto, los hallazgos del presente estudio son un conocimiento valioso en la conservación y gestión de las poblaciones de peces estuarinos.