El objetivo de esta investigación fue evaluar el efecto de la composición del sedimento en la dinámica del metano (CH₄) en sedimentos de diferentes áreas de la zona de transición entre un manglar y el mar. Esta investigación se llevó a cabo en un manglar en Coroa Grande, en la costa sur de Río de Janeiro. Se recolectaron muestras en tres estaciones: (1) región colonizada por Rhizophora mangle L. en el borde del manglar, (2) región colonizada por pastos marinos y (3) región infralitoral sin vegetación. Se recolectaron muestras de la capa superficial del sedimento para determinar las concentraciones de nutrientes (C, N y P) y la concentración y producción de CH₄. Se observó que las concentraciones de CH₄ y carbono (C) fueron significativamente mayores (p < 0,05) en la estación 1 que en la estación 3. Las relaciones molares (C:N, C:P y N:P) sugieren que el origen del sustrato es principalmente autóctono. La metanogénesis fue inicialmente baja, posiblemente debido a la competencia entre metanógenos y reductores de sulfato, y aumentó significativamente (p < 0,05) el día vigésimo sexto en el sedimento de la estación 1, probablemente debido a la mayor disponibilidad de materia orgánica (MO) en esta región. Los resultados indican que la actividad metanogénica observada aquí no está regulada por la cantidad o calidad de la MO, sino por otros factores. La concentración de CH4 en el ecotono mar-tierra del manglar Coroa Grande depende de la MO disponible, lo que sugiere una posible inhibición de la metanotrofia por el intenso consumo de oxígeno en la superficie del suelo cubierta por detritos de vegetación de Rhizophora mangle.