Los mújoles (Mugilidae) presentan un potencial significativo para la diversificación de la acuicultura sostenible debido a su naturaleza euri térmica, euri halina y de bajo trófico. Sin embargo, las diferencias fisiológicas y las condiciones óptimas de cultivo entre las diversas especies de mújoles son bastante desconocidas. Por estas razones, el presente estudio tuvo como objetivo abordar dos objetivos principales: (1) caracterizar las diferencias en la bioquímica digestiva, los índices somáticos y la composición corporal entre dos especies de mújoles; y (2) evaluar las interacciones de dos frecuencias de alimentación diferentes (una contra tres comidas al día) sobre los parámetros mencionados anteriormente, y también sobre la potencial biodisponibilidad de nutrientes determinados mediante ensayos in vitro. Los resultados evidenciaron actividades más altas de proteasa y amilasa para una especie que para la otra, mientras que esta última presentó un mayor porcentaje de peso eviscerado y lípidos musculares. Además, los resultados de los ensayos in vitro respaldaron la mayor actividad enzimática de una especie por un aumento observado en la liberación de aminoácidos y azúcares reductores medidos para esta especie. En cuanto a los patrones de alimentación, los resultados de los ensayos in vitro que simulan las proporciones de enzima: sustrato (E:S) correspondientes a una o tres comidas al día apuntan a un claro aumento de la biodisponibilidad de nutrientes cuando la ración diaria se divide en varias comidas. Los resultados presentes mejoran el conocimiento fisiológico de las especies de mújoles y definen criterios para desarrollar mejores protocolos de manejo por parte de los productores.