El metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) en el mercado de pescado y en los restaurantes de mariscos cercanos en Taiwán revela la subestimación de la diversidad de especies de peces en los mariscos
Autores: Lee, Hung-Tai; Liao, Cheng-Hsin; Hsu, Te-Hua
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
El metabarcoding de ADN ambiental (eDNA) en el mercado de pescado y en los restaurantes de mariscos cercanos en Taiwán revela la subestimación de la diversidad de especies de peces en los mariscos
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Mariscos
Composición de especies
Enfoque basado en ADN
Metabarcado de eDNA
Mercados de pescado
Especies de pescado
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 19
Citaciones: Sin citaciones
Los mariscos, especialmente los tradicionales de Taiwán, rara vez se obtienen de una especie fija y rutinariamente de especies similares dependiendo de su disponibilidad. Por lo tanto, la composición de especies de mariscos puede ser complicada. Si bien se ha utilizado un enfoque basado en ADN para la identificación de especies, la identificación a gran escala de mariscos en mercados de pescado y restaurantes podría ser un desafío (por ejemplo, el costo elevado y el tiempo que consume solo para un número limitado de identificaciones de especies). En el presente estudio, nuestro objetivo fue identificar la mayoría de las especies de peces que potencialmente se consumen en mercados de pescado y restaurantes de mariscos cercanos utilizando metabarcoding de ADN ambiental (eDNA). Se realizaron cuatro muestreos de eDNA en un mercado de pescado local y en restaurantes de mariscos cercanos utilizando cartuchos Sterivex. Se utilizaron diecinueve cebadores universales previamente validados para la identificación de especies de peces para amplificar los fragmentos de ADN mitocondrial (12S, COI, ND5) de las especies en las muestras de eDNA y se secuenciaron con la secuenciación NovaSeq 6000. Se han identificado un total de 153 especies de peces basadas en 417 unidades operativas de taxonomía (OTUs) relacionadas con peces generadas a partir de 50,534,995 lecturas. El Análisis de Coordenadas Principales (PCoA) mostró además las diferencias en las especies de peces entre los tiempos de muestreo y los sitios de muestreo. De estas especies de peces, 22 peces condrictios, 14 especies de Anguilliformes y 15 especies de Serranidae se asociaron respectivamente con tiburones ahumados, anguilas morenas guisadas y sopas de mero. Hasta donde sabemos, este trabajo representa el primer estudio que demuestra la viabilidad de una identificación a gran escala de mariscos utilizando el enfoque de metabarcoding de eDNA. Nuestros hallazgos también implican que la diversidad de especies en los mariscos tradicionales podría estar seriamente subestimada y es crucial para la conservación y gestión de los recursos marinos.
Descripción
Los mariscos, especialmente los tradicionales de Taiwán, rara vez se obtienen de una especie fija y rutinariamente de especies similares dependiendo de su disponibilidad. Por lo tanto, la composición de especies de mariscos puede ser complicada. Si bien se ha utilizado un enfoque basado en ADN para la identificación de especies, la identificación a gran escala de mariscos en mercados de pescado y restaurantes podría ser un desafío (por ejemplo, el costo elevado y el tiempo que consume solo para un número limitado de identificaciones de especies). En el presente estudio, nuestro objetivo fue identificar la mayoría de las especies de peces que potencialmente se consumen en mercados de pescado y restaurantes de mariscos cercanos utilizando metabarcoding de ADN ambiental (eDNA). Se realizaron cuatro muestreos de eDNA en un mercado de pescado local y en restaurantes de mariscos cercanos utilizando cartuchos Sterivex. Se utilizaron diecinueve cebadores universales previamente validados para la identificación de especies de peces para amplificar los fragmentos de ADN mitocondrial (12S, COI, ND5) de las especies en las muestras de eDNA y se secuenciaron con la secuenciación NovaSeq 6000. Se han identificado un total de 153 especies de peces basadas en 417 unidades operativas de taxonomía (OTUs) relacionadas con peces generadas a partir de 50,534,995 lecturas. El Análisis de Coordenadas Principales (PCoA) mostró además las diferencias en las especies de peces entre los tiempos de muestreo y los sitios de muestreo. De estas especies de peces, 22 peces condrictios, 14 especies de Anguilliformes y 15 especies de Serranidae se asociaron respectivamente con tiburones ahumados, anguilas morenas guisadas y sopas de mero. Hasta donde sabemos, este trabajo representa el primer estudio que demuestra la viabilidad de una identificación a gran escala de mariscos utilizando el enfoque de metabarcoding de eDNA. Nuestros hallazgos también implican que la diversidad de especies en los mariscos tradicionales podría estar seriamente subestimada y es crucial para la conservación y gestión de los recursos marinos.