La seguridad alimentaria y la producción de cultivos se ven desafiadas en todo el mundo debido a la sobrepoblación, cambios en las condiciones ambientales, fallas en el establecimiento de cultivos y diversos tipos de pérdidas post-cosecha. La demanda de alimentos de alta calidad con una calidad nutricional mejorada también está creciendo día a día. Por lo tanto, la producción de productos de alta calidad y la reducción de las pérdidas post-cosecha de productos, especialmente de frutas y verduras perecederas, son vitales. Durante muchas décadas, se han realizado intentos para mejorar los rasgos de calidad post-cosecha de los cultivos hortícolas. Recientemente, las herramientas genéticas modernas como la edición del genoma han surgido como un nuevo enfoque para gestionar y superar de manera efectiva y eficiente la post-cosecha. Las diferentes herramientas de edición del genoma, incluidas las ZFN, TALEN y el sistema CRISPR/Cas9, introducen mutaciones (InDels) de manera efectiva en muchos cultivos hortícolas para abordar y resolver los problemas asociados con la calidad de almacenamiento post-cosecha. Por lo tanto, proporcionamos una amplia revisión de las aplicaciones de la edición del genoma en cultivos hortícolas para mejorar rasgos de estabilidad post-cosecha como vida útil, textura y resistencia a patógenos sin comprometer el valor nutricional. Además, también se discuten los principales obstáculos, desafíos y sus posibles soluciones para emplear herramientas de edición del genoma.