El diseño específico de tareas de líquidos iónicos (ILs) ha surgido en varias aplicaciones industriales y farmacéuticas. La familia de ILs con etiquetas de fluoruro iguales o más largas que cuatro átomos de carbono, los líquidos iónicos fluorados (FILs), combinan las mejores propiedades de los ILs con las de los compuestos perfluorados, y están siendo diseñados para varios propósitos específicos. En el campo farmacéutico, hay una urgencia en la búsqueda de nuevos agentes antibacterianos para superar los problemas asociados a las resistencias antimicrobianas. Por lo tanto, el propósito principal de este trabajo es evaluar el impacto ambiental y la capacidad de los FILs de ser utilizados como agentes antibacterianos contra las bacterias. Más allá de su rara patogenicidad, estas bacterias también se utilizan como agentes de biorremediación para tratar varios sitios de contaminación. Por lo tanto, es importante determinar qué FILs tienen propiedades antibacterianas y cuáles no impactan en el crecimiento bacteriano. La biocompatibilidad de los FILs también fue evaluada a través de su actividad hemolítica y representa un avance en la aplicación de los FILs en aplicaciones farmacéuticas. Los resultados demostraron que altas concentraciones de FILs pueden tener una ecotoxicidad reducida y una alta biocompatibilidad. El [CCIm][CFSO] fue identificado como el compuesto más prometedor para ser utilizado como agente antibacteriano ya que evita el crecimiento de bacterias a concentraciones compatibles con la viabilidad de los glóbulos rojos.