La composición, actividad y robustez de las comunidades bacterianas determina la efectividad de las unidades de biofiltración para la desulfurización del biogás. Por lo tanto, es importante comprender mejor las comunidades bacterianas que coexisten en las unidades de biofiltración bajo diferentes condiciones operativas para la eliminación de HS, el principal compuesto de azufre reducido que se debe eliminar en el biogás. Esta revisión presenta las principales características de las bacterias quimiotróficas oxidantes de azufre que son la base de la transformación biológica de HS en productos inocuos en los biofiltros. A continuación, se presenta una encuesta de las tecnologías de biofiltración existentes en relación con la eliminación de HS, seguida de una revisión de los estudios de ecología microbiana realizados hasta la fecha en unidades de filtro biotrickling para el tratamiento de HS en biogás bajo condiciones aeróbicas y anóxicas.