El presente estudio investigó las relaciones ecológicas entre endoparásitos y el hospedador Potamotrygon falkneri del Alto Paraná, utilizando como indicadores el factor de condición relativa (Kn), el sexo y la relación hepatosomática (HSR) del hospedador. Se analizaron cuarenta y siete especímenes de P. falkneri entre marzo de 2005 y septiembre de 2006. El análisis estadístico mostró que el Kn se correlacionó positivamente con la abundancia de Acanthobothrium regoi y Rhinebothrium paratrygoni; solo la abundancia de A. regoi se correlacionó positivamente con la HSR, mientras que R. paratrygoni no presentó correlación y no se observó influencia del sexo del hospedador en la abundancia y prevalencia de parásitos. Este es el primer estudio sobre la ecología de parásitos de potamotrigónidos.