Objetivo: Este estudio investigó los cambios en la composición dietaria y la amplitud del nicho trófico de Eigenmannia desantanai en el contexto de los períodos hidrológicos, ríos y ontogenia.

Métodos: Las colectas se realizaron mensualmente en los ríos Paraguay y Amonguijá entre febrero de 2009 y enero de 2011.

Resultados: Se recolectaron un total de 338 especímenes de E. desantanai, 224 provenientes del río Amonguijá y 114 del río Paraguay. En total se identificaron 21 ítems alimenticios. Los restos completamente digeridos de animales (RDA), Chironomidae, Cladocera y Ostracoda mostraron mayor importancia en la dieta de E. desantanai. La composición dietaria fue influenciada por los períodos hidrológicos, seguidos por diferencias entre los ríos muestreados y la ontogenia. En contraste, solo los períodos hidrológicos explicaron la variación en la amplitud del nicho trófico de E. desantanai.

Conclusiones: La dieta de E. desantanai se compone principalmente de Chironomidae, Cladocera y Ostracoda; sin embargo, los individuos consumieron otros ítems alimenticios debido a los cambios en los períodos hidrológicos, seguidos por las características de los ríos Amonguijá y Paraguay y la variación ontogenética. En este sentido, los resultados de este estudio son relevantes para la ecología alimentaria de E. desantanai, proporcionando directrices para su manejo y conservación.