Como el único linaje acuático de Pteridaceae, Parkerioideae se distingue de muchas especies adaptadas a ambientes xerófitos de la familia y consiste en las especies de agua dulce y los únicos helechos de manglar del género. Estudios previos han demostrado que la duplicación del genoma completo (WGD) ha ocurrido en Parkerioideae al menos una vez y puede haber jugado un papel en su evolución adaptativa; sin embargo, se requiere más investigación en profundidad al respecto. En este estudio, se llevaron a cabo análisis de transcriptómica comparativa y evolutiva para identificar WGD y explorar sus roles en la adaptación ambiental de Parkerioideae. Se identificaron tres eventos de WGD putativos dentro de Parkerioideae, dos de los cuales fueron específicos de y, respectivamente. El análisis de enriquecimiento funcional indicó que los eventos de WGD específicos de linaje han jugado un papel en la adaptación de Parkerioideae a las bajas concentraciones de oxígeno de los hábitats acuáticos, así como a diferentes entornos acuáticos de y, como la adaptación de a niveles reducidos de luz y la adaptación de a alta salinidad. El análisis de selección positiva proporcionó además evidencia de que los eventos de WGD putativos pueden haber facilitado la adaptación de Parkerioideae a los cambios en el hábitat. Además, el análisis de familias de genes indicó que la H-ATPasa de membrana plasmática, la H-ATPasa vacuolar y el supresor del defecto de crecimiento por transporte de K 1 pueden haber estado involucrados en la adaptación a alta salinidad de. Nuestro estudio proporciona nuevas perspectivas sobre la evolución y las adaptaciones de Parkerioideae en diferentes entornos acuáticos.